Единый тест COVID-19: обнаружение, отслеживание вариантов и совместные инфекции в одной процедуре

Новый тип стратегии тестирования COVID-19 может помочь оптимизировать процесс выявления случаев, отслеживания вариантов и обнаружения совместно инфицирующих вирусов. В настоящее время отдельные анализы и сложные рабочие процессы задействованы в каждой из этих трех диагностических процедур, с анализом, обычно выполняемым в высокоспециализированных учреждениях. Исследователи теперь объединили все три вида тестов в одну процедуру, которая должна позволить точечный уход за COVID-19 и множеством возникающих вариантов SARS-CoV-2.

Тест включает портативную мини-лабораторию размером с чемоданчик, которая избегает медленных и дорогих техник, стандартных для скрининга и мониторинга COVID-19. Тест использует генетический метод (называемый изотермической амплификацией рекомбиназ-зависимой полимеразы) и портативный секвенсор для быстрого обнаружения наличия вирусных последовательностей и предоставления результатов до для 96 образцов пациентов одновременно.

Тест разработан для декодирования пяти сегментов генома SARS-CoV-2, каждый выбранный для помощи в отслеживании вариантов. Исследователи также включили анализы для трех распространенных респираторных вирусов, которые могут вызывать симптомы, похожие на COVID-19.

Команда подтвердила технику — называемую NIRVANA — используя носовые и горловые мазки от людей, подозреваемых в инфекции SARS-CoV-2. Они также протестировали образцы сточных вод, собранные из городской канализации, чтобы показать, как метод может позволить популяционный мониторинг SARS-CoV-2 и других вирусов.

Одним ограничением теста является то, что он может обнаруживать мутации SARS-CoV-2 только в выбранных гномных регионах, и по мере того как новые варианты обеспокоенности продолжают появляться по всему миру, эти регионы могут потребовать обновления для отражения эволюционной природы вируса.