Универсальный тест для мониторинга COVID-19

Новый тип стратегии тестирования на COVID-19 может помочь упростить процесс выявления случаев, отслеживания вариантов и обнаружения коинфицирующих вирусов. В настоящее время каждая из этих трех диагностических процедур включает отдельные анализы и сложные рабочие процессы, при этом анализы обычно выполняются в узкоспециализированных учреждениях. Теперь исследователи объединили все три вида тестов в единую процедуру, которая должна позволить отслеживать COVID-19 и множество новых вариантов SARS-CoV-2 по месту оказания медицинской помощи.

Тест включает в себя портативную мини-лабораторию размером с портфель, которая позволяет избежать медленных и дорогостоящих методов, которые являются стандартными для скрининга и мониторинга COVID-19. В тесте используется генетический метод (так называемый рекомбиназно-полимеразная амплификация) и портативный секвенатор для быстрого обнаружения присутствия вирусных последовательностей и одновременного считывания до 96 образцов пациентов.

Тест был разработан для декодирования пяти сегментов генома SARS-CoV-2, каждый из которых выбран для помощи в отслеживании вариантов. Исследователи также включили тесты на три распространенных респираторных вируса, которые могут вызывать симптомы, сходные с COVID-19.

Команда проверила метод под названием NIRVANA с использованием мазков из носа и горла у людей с подозрением на инфекцию SARS-CoV-2. Они также протестировали образцы сточных вод, собранные из муниципальных сточных вод, чтобы показать, как этот метод может позволить проводить эпиднадзор за SARS-CoV-2 и другими вирусами на уровне населения.

Одним из ограничений теста является то, что он может обнаруживать мутации SARS-CoV-2 только в выбранных областях генома, и, поскольку новые варианты, вызывающие озабоченность, продолжают появляться во всем мире, может потребоваться обновление этих областей, чтобы отразить эволюционирующую природу вируса.